Das von Flybook vorinstallierte Windows XP ServicePack2 arbeitet schnell und ohne Verzögerungen. Man Windows nur auf der Standardauflösung laufen lassen und kann keine höhere Auswählen. Alle Treiber sind einwandfrei installiert und man kann sofort loslegen egal ob es mit W-Lan, Bluetooth oder dem SIM-Card-Reader ist. Im Tablet-PC-Modus gibt es kaum Probleme. Es kommt manchmal vor das der Mauszeiger nicht direkt reagiert und man nochmals klicken muss, aber sonst gibt es keine Probleme unter Windows XP mit dem Touchscreen.

Windows Vista ist die neueste Kreation von Microsoft. Die installierte Ultimate Edition läuft schnell, aber die Fn-Tasten funktionieren nur wenn man die passenden Treiber installiert hat. Die meisten Hersteller fangen momentan an ihre Treiber für Windows Vista bereitzustellen, aber es dauert noch einige Zeit bis man alle Treiber runterladen kann. Windows XP und Vista teilen sich eine Festplatte mit zwei Partitionen ohne Probleme. Im Tablet-PC-Modus gibt es, wie bei XP, keine Probleme, bis auf das manchmal auftretende Springen des Mauszeigers.