Windows war auf dem Notebook schon vorinstalliert. Es lief daher flüssig und gut. Alle Stromsparfunktionen wurden unterstützt und das Wechseln zwischen Programmen war kein Problem. Die Benutzung des Betriebssystems gestaltete sich komplett problemlos. Das Notebook bootet die Windows-Installations-CD automatisch, sodass man keine Veränderung im Bios vornehmen muss.

Die Suse Linux 10.0 DVD startete ohne Probleme, weshalb eine fortführende Installation zu erwarten ist. Leider war ein weitgehender Test nicht möglich. Im Internet findet man mehrere Kommentare zum Linuxbetrieb auf dem Toshiba Tecra S3: Suse Linux scheint im Allgemeinen zu funktionieren, jedoch gibt es noch Probleme mit Suspend to Disk und mit den eingebauten Lautsprechern bzw. Audio System.